Морфологическая и молекулярная филогения дилептидных и трахелиидных инфузорий: Разрешение на основании класса Litostomatea (Ciliophora, Rhynchostomatia)
Бергер Х. Монография Urostyloidea (Ciliophora, Hypotricha) Monogr. биол. 2006; 85:1–1304. [Google Scholar]
Claparède É., Lachmann J. Исследования инфузорий и корненожек. Мем. Инст. физ. женев. 1859; 6: 261–482. [Google Scholar]
Корлисс Дж.О. 2-е изд. Пергамон Пресс; Оксфорд, Нью-Йорк, Торонто, Сидней, Париж, Франкфурт: 1979. Ресничные простейшие. Характеристика, классификация и справочник по литературе. [Google Scholar]
Драгеско Дж. Захват и проглатывание продуктов из инфузорий. Бык. биол. о. бельг. 1962; 96: 123–167. [Google Scholar]
Dragesco J. Обзор жанра Dileptus , Dujardin 1871 (Ciliata Holotricha) (систематическая, цитологическая, биологическая) Bull. биол. о. бельг. 1963; 97: 103–145. [Google Scholar]
Dragesco J., Métain C. La Capitol des proies chez Dileptus gigas (Cilié Holotrice) Bull.
соц. Зоол. о. 1948; 73: 62–65. [Google Scholar]
Дюжарден Ф. Энциклопедическая библиотека Роре; Париж: 1841 г. Histoire naturelle des zoophytes. Infusoires, comprenant la physiologie et la classification de ces animaux et la maniére de les etudier a l’aide du микроскоп. [Google Scholar]
Эренберг К.Г. Верлаг фон Леопольд Фосс; Лейпциг: 1838 г. Die Infusionsthierchen als vollkommene Organismen. Ein Blick in das tiefere organische Leben der Natur. [Академия Google]
Элвуд Х.Дж., Олсен Г.Дж., Согин М.Л. Последовательности гена малой субъединицы рибосомной РНК инфузории гипотрихоза Oxytrichanova и Stylonychia pustulata . Мол. биол. Эвол. 1985; 2: 399–410. [PubMed] [Google Scholar]
Фойсснер В. Infraciliatur, Silberliniensystem und Biometrie einiger neuer und wenig bekannter terrestrischer, limnischer und Mariner Ciliaten (Protozoa: Ciliophora) aus den Klassen Kinetofragminophora, Colpodea und Polyhymenophora. Стапфия (Линц) 1984;12:1–165.
Фойснер В. Основные методы световой и сканирующей электронной микроскопии для таксономических исследований реснитчатых простейших. Евро. Дж. Протистол. 1991; 27: 313–330. [PubMed] [Google Scholar]
Фойснер В. Фаунистические и таксономические исследования инфузорий (Protozoa, Ciliophora) из чистых рек Баварии (Германия) с описаниями новых видов и экологическими заметками. Лимнологика. 1997; 27: 179–238. [Google Scholar]
Фойсснер В. Обновленный сборник мировых почвенных инфузорий (Protozoa, Ciliophora) с экологическими примечаниями, новыми записями и описаниями новых видов. Евро. Дж. Протистол. 1998;34:195–235. [Google Scholar]
Foissner W. Два новых наземных спатидиевых (Protozoa, Ciliophora) из тропической Африки: Arcuospathidium vlassaki и Arcuospathidium bulli . биол. Плодородный. Почвы. 2000; 30: 469–477. [Google Scholar]
Фойснер В. Два замечательных почвенных спатидиевых (Ciliophora: Haptorida), 
н. и Spathidium faurefremieti ном. н. Акта Протозол. 2003; 42: 145–159. [Академия Google]
Фойснер В., Фойснер И. Оральные монокинетиды у свободноживущих гапторовых инфузорий Enchelydium polynucleatum (Ciliophora, Enchelyidae): ультраструктурные данные и филогенетические последствия. Дж. Протозол. 1985; 32: 712–722. [Google Scholar]
Foissner W., Foissner I. Тонкое строение Fuscheria terricola Berger et al., 1983 и предлагаемая новая классификация подкласса Haptoria Corliss, 1974 (Ciliophora, Litostomatea) Arch. Протистенк. 1988; 135: 213–235. [Академия Google]
Фойсснер В., Бергер Х., Блаттерер Х., Кохманн Ф. Таксономическая и экологическая ревизия Ciliaten des Saprobiensystems – Band IV: Gymnostomatea, Loxodes . Суктория. Informationsberichte де Байер. Landesamtes für Wasserwirtschaft. 1995;1(95):1–540. [Google Scholar]
Фойсснер В., Бергер Х., Шаумбург Дж. Идентификация и экология пресноводных планктонных инфузорий.
Informationsberichte де Байер. Landesamtes für Wasserwirtschaft. 1999;3(99):1–793. [Академия Google]
Фойсснер В., Агата С., Бергер Х. Почвенные инфузории (Protozoa, Ciliophora) из Намибии (Юго-Западная Африка) с акцентом на двух контрастирующих средах: регионе Этоша и пустыне Намиб. Денисия. 2002; 5:1–1459. [Google Scholar]
Габилондо Р., Фойсснер В. Четыре новых фушериевых почвенных инфузории (Ciliophora: Haptorida) из четырех биогеографических регионов. Акта Протозол. 2009; 48:1–24. [Google Scholar]
Gao S., Song W., Ma H., Clamp J.C., Yi Z., Al-Rasheid K.A.S., Chen Z., Lin X. Филогения шести родов подкласса Haptoria (Ciliophora, Litostomatea) выведено из последовательностей гена, кодирующего малую субъединицу рибосомной РНК. Дж. Эукариот. микробиол. 2008; 55: 562–566. [PubMed] [Академия Google]
Голиньская К. Макронуклеус в Dileptus cygnus и его изменения в делении. Акта Протозол. 1965; 3: 143–151. [Google Scholar]
Голиньская К. Сравнительные исследования морфологии Dileptus anatinus sp.
н. (Holotricha, Gymnostomata) Acta Protozool. 1971; 8: 367–378. [Google Scholar]
Golińska K. Влияние пуромицина на процессы регенерации у Dileptus anatinus , Golinska 1971. Acta Protozool. 1974; 12: 289–306. [Академия Google]
Golińska K. Курс ремоделирования in situ поврежденного ротового аппарата у Dileptus (Ciliata, Gymnostomata) Acta Protozool. 1978; 17: 47–67. [Google Scholar]
Голиньская К. Регуляция цилиарного рисунка у Dileptus (Ciliata). I. Чувствительные реснички и их превращение в локомоторные реснички. Дж. Эмбриол. Эксп. Превращаться. 1982; 68: 99–114. [PubMed] [Google Scholar]
Golińska K. Регуляция цилиарного рисунка у Dileptus (Ciliata). II. Формирование коркового домена сенсорных ресничек из домена локомоторных ресничек. Дж. Клеточные науки. 1983;62:459–475. [PubMed] [Google Scholar]
Golińska K. Комплексы кортикальных органелл, их структура, формирование и влияние на форму клетки у инфузории, Dileptus .
Протоплазма. 1991; 162: 160–174. [Google Scholar]
Голиньская К. Формирование и ориентация элементов скелета при развитии ротовой области у инфузории, Dileptus . Акта Протозол. 1995; 34: 101–113. [Google Scholar]
Голиньская К., Афонькин С.Ю. Подготовительные изменения и развитие конъюгационного перехода у инфузории, Дилептус . Протоплазма. 1993; 173: 144–157. [Google Scholar]
Grain J., Golińska K. Структура и ультраструктура Dileptus cygnus Claparède et Lachmann, 1859, Cilié Holotrice Gymnostome. Протистология. 1969; 5: 269–291. [Google Scholar]
Холл Т.А. BioEdit: удобный редактор выравнивания биологических последовательностей и программа анализа для Windows 95/98/NT. Симптом нуклеиновых кислот. сер. 1999;41:95–98. [Google Scholar]
Хейс М.Л. Цитологическое исследование на Diлептус anser . Транс. Являюсь. микроск. соц. 1938; 57: 11–25. [Google Scholar]
Hennig W. University of Illinois Press; Урбана, Чикаго, Лондон: 1966.
Филогенетическая систематика. [Google Scholar]
Хёрандль Э. Парафилетические и монофилетические таксоны — эволюционные и кладистические классификации. Таксон. 2006; 55: 564–570. [Google Scholar]
Хёрандл Э., Стюесси Т.Ф. Парафилетические группы как естественные единицы биологической классификации. Таксон. 2010;59:1641–1653. [Академия Google]
Международная комиссия по зоологической номенклатуре (ICZN) 4-е изд. Международный фонд зоологической номенклатуры; Лондон: 1999. Международный кодекс зоологической номенклатуры. [Google Scholar]
Янковский А.В. Новые роды классов Gymnostomatea и Ciliostomea [Новые роды классов Gymnostomatea и Ciliostomea] Mater. IV. Конф. уч. Секц. зоол. (Кишинев) 1967:36. (на русском языке) [Google Scholar]
Янковский А.В. Конспект новой системы типа Ciliophora // Труды зоол. Инст. (Ленинград) 1980;94:103–121. (in Russian) [Google Scholar]
Джонс Э.Э., мл. Инцистментация, эксцистментация и ядерный цикл у инфузории Dileptus anser .
Дж. Элиша Митчелл Науч. соц. 1951; 67: 205–217. [Google Scholar]
Kahl A. Urtiere oder Protozoa I: Wimpertiere oder Ciliata (Infusoria) 2. Holotricha außer den im 1. Teil behandelten Prostomata. Tierwelt Dtl. 1931; 21: 181–398. [Google Scholar]
Лейпе Д.Д., Бернхард Д., Шлегель М., Согин М.Л. Эволюция генов 16S-подобных рибосомных РНК у таксонов цилиофор Litostomatea и Phyllopharyngea. Евро. Дж. Протистол. 1994;30:354–361. [Google Scholar]
Липскомб Д.Л. Парсимония, гомология и анализ мультистатических признаков. кладистический. 1992; 8: 45–65. [Google Scholar]
Людвиг В., Странк О., Вестрам Р., Рихтер Л., Мейер Х., Ядхукумар, Бюхнер А., Лай Т., Степпи С., Джобб Г., Фёрстер В., Бретске И. ., Гербер С., Гинхарт А.В., Гросс О., Груманн С., Герман С., Йост Р., Кениг А., Лисс Т., Люссманн Р., Мэй М., Нонхофф Б., Райхель Б., Штрелов Р., Стаматакис А., Штукманн Н., Вилбиг А., Ленке М., Людвиг Т., Боде А., Шлейфер К.-Х. ARB: программная среда для данных последовательности.
Линн Д.Х. 3-е изд. Спрингер; Дордрехт: 2008. Ресничные простейшие. Характеристика, классификация и справочник по литературе. [Google Scholar]
Линн Д.Х., Смолл Э.Б. Phylum Ciliophora Doflein, 1901. В: Ли Дж. Дж., Лидейл Г. Ф., Брэдбери П., редакторы. 2-е изд. об. 1. Аллен Пресс; Лоуренс, Канзас: 2002. стр. 371–656. (Иллюстрированный справочник по простейшим). [Google Scholar]
Медлин Л.К., Элвуд Х.Дж., Стикель С., Согин М.Л. Характеристика ферментативно амплифицированных эукариотических 16S-подобных рРНК-кодирующих областей. Ген. 1988;71:491–499. [PubMed] [Google Scholar]
Мюллер К. PRAP-вычисления поддержки Бремера для больших наборов данных. Мол. Филогенет. Эвол. 2004; 31: 780–782. [PubMed] [Google Scholar]
Мюллер, О.Ф., 1773. Vermium terrestrium et fluviatilium, seu animalium infusoriorum, helminthicorum et testaceorum, non marinorum, succincta historia.
Пан Х., Гао Ф., Ли Дж., Линь С., Аль-Фаррадж С.А., Аль-Рашеид К.А.С. Морфология и филогения двух новых плевростоматидных инфузорий, Epiphyllum shenzhenense н. сп. и Loxophyllum spirellum n. сп. (Protozoa, Ciliophora) из мангровых водно-болотных угодий, Южный Китай. Дж. Эукариот. микробиол. 2010;57:421–428. [PubMed] [Google Scholar]
Penard E. Georg & Cie; Женева: 1922. Этюды сюр-ле-инфузуаров д’дьюс. [Google Scholar]
Посада Д., Крэндалл К.А. MODELTEST: тестирование модели замещения ДНК. Биоинформатика. 1998; 14:817–818. [PubMed] [Google Scholar]
Райков И.Б. Ядра инфузорий. В: Hausmann K., Bradbury BC, редакторы. Инфузории: клетки как организмы. Фишер Верлаг; Штутгарт, Йена, Нью-Йорк: 1996. стр. 221–242. [Google Scholar]
Ронквист Ф., Хюльзенбек Дж. П. MrBayes 3: Байесовский филогенетический вывод в смешанных моделях. Биоинформатика. 2003; 19: 1572–1574. [PubMed] [Google Scholar]
Schewiakoff W.
Организация и систематика инфузорий Aspirotricha ( Holotricha auctorum ) [Организация и систематика инфузорий Aspirotricha ( Holotricha auctorum )] Зап. имп. акад. Наук (8e Série) 1896; 4: 1–395. (in Russian) [Google Scholar]
Schmidt S.L., Foissner W., Schlegel M., Bernhard D. Молекулярная филогения Heterotrichea (Ciliophora, Postciliodesmatophora) на основе последовательностей генов малых субъединиц рРНК. Дж. Эукариот. микробиол. 2007; 54: 358–363. [PubMed] [Академия Google]
Шенборн В. А. Цимсен; Wittenberg Lutherstadt: 1966. Beschalte Amöben (Testacea) [Google Scholar]
Schrank F. von P. Bd. 3. Штейн; Landshut bei Krüll: 1803 г. (Fauna Boica. Durchgedachte Geschichte der in Baiern einheimischen und zahmen Thiere). [Google Scholar]
Шимано С., Санбе М., Касахара Ю. Связь между наблюдениями под световым микроскопом и молекулярным анализом с помощью ПЦР одиночных клеток для инфузорий. Микробы Окружающая среда. 2008; 23: 356–359. [PubMed] [Академия Google]
Song W.
, Wilbert N. Taxonomische Untersuchungen an Aufwuchsciliaten (Protozoa, Ciliophora) im Poppelsdorfer Weiher, Bonn. Лаутерборния. 1989; 3: 2–221. [Google Scholar]
Stamatakis A., Hoover P., Rougemont J. Алгоритм быстрой загрузки для веб-серверов RAxML. Сист. биол. 2008; 75: 758–771. [PubMed] [Google Scholar]
Strüder-Kypke M.C., Lynn D.H. Анализ последовательности гена малой субъединицы рРНК подтверждает парафилию олиготриховых инфузорий sensu lato и поддерживает монофилию подклассов Oligotrichia и Choreotrichia (Ciliophora, Spirotrichea) J. Zool . (Лондон) 2003; 260:87–97. [Google Scholar]
Strüder-Kypke M.C., Wright A.-D.G., Foissner W., Chatzinotas A., Lynn D.H. Молекулярная филогения литостомовых инфузорий (Ciliophora, Litostomatea) с акцентом на свободноживущие роды гапториан. Протист. 2006; 157: 261–278. [PubMed] [Google Scholar]
Стрюдер-Кипке М.С., Корнилова О.А., Линн Д.Х. Филогения трихостомных инфузорий (Ciliophora, Litostomatea) эндосимбиотических у якутской лошади ( Equus caballus ) Eur.
Дж. Протистол. 2007;43:319–328. [PubMed] [Академия Google]
Своффорд Д.Л. Синауэр Ассошиэйтс, Инк.; Сандерленд, Массачусетс: 2003. PAUP*. Филогенетический анализ с использованием экономии (* и другие методы). Версия 4. [Google Scholar]
Thamm M., Schmidt S.L., Bernhard D. Взгляд на филогению рода Stentor (Heterotrichea, Ciliophora) с особым акцентом на эволюцию макронуклеуса на основе данных рДНК SSU. Акта Протозол. 2010;49:149–157. [Google Scholar]
Вячный П., Фойсснер В. Морфология, конъюгация и постконъюгационная реорганизация Dileptus tirjakovae н. сп. (Ciliophora, Haptoria) J. Eukaryot. микробиол. 2008; 55: 436–447. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Vďačný P., Foissner W. Описание четырех новых почвенных дилептидов (Ciliophora, Haptoria) с примечаниями об адаптации к почвенной среде. Акта Протозол. 2008; 47: 211–230. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Vďačný P., Foissner W. Онтогенез Dileptus terrenus и Pseudomonilicaryon brachyproboscis (Ciliophora, Haptoria) J.
Eukaryot. микробиол. 2009; 56: 232–243. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]
Vďačný P., Orsi W., Foissner W. Молекулярные и морфологические доказательства родственных связей классов Armophorea и Litostomatea (Ciliophora, Intramacronucleata, Lamellicorticata infraphyl. nov. ), с учетом базальных гапторид литостоматов. Евро. Дж. Протистол. 2010; 46: 298–309. [PubMed] [Google Scholar]
Вячный П., Бурланд В.А., Орси В., Эпштейн С.С., Фойснер В. Филогения и классификация Litostomatea (Protista, Ciliophora) с акцентом на свободноживущие таксоны и ген 18S рРНК . Мол. Филогенет. Эвол. 2011;59: 510–522. [PubMed] [Google Scholar]
Винникова Н.В. Конъюгация у Dileptus anser (O.F.M.) (Gymnostomatida, Tracheliidae) Acta Protozool. 1974; 12: 275–287. (на русском языке с английским переводом названия и английской аннотацией) [Google Scholar]
Винникова Н.В. Тонкие структурные изменения макронуклеусов Dileptus anser О.Ф.М. при конъюгации. Акта Протозол.
1974; 13: 97–106. (на русском языке с английским переводом названия и аннотацией на английском языке) [Google Scholar]
Винникова Н.В. Конъюгация у инфузории Dileptus anser . I. Ультраструктура микроядер при митозе и мейозе. Протистология. 1976; 12:7–24. [Google Scholar]
Visscher J.P. Пищевые реакции у инфузорий, Dileptus gigas , с особым упором на функцию трихоцист. биол. Бык. Мар биол. лаборатория (Вудс-Хоул) 1923; 45: 113–143. [Google Scholar]
Visscher J.P. Конъюгация у реснитчатых простейших, Dileptus gigas , со специальной ссылкой на ядерные явления. Дж. Морфол. 1927; 44: 383–415. [Google Scholar]
Wenrich D.H. Наблюдения за некоторыми пресноводными инфузориями (Protozoa) II. Парадилептус , н. ген. Транс. Являюсь. микроск. соц. 1929; 48: 352–365. [Google Scholar]
Wiens J.J. Кодирование морфологических вариаций внутри видов и высших таксонов для филогенетического анализа. В: Wiens JJ, редактор. Филогенетический анализ морфологических данных.
Пресса Смитсоновского института; Вашингтон, Лондон: 2000. стр. 115–145. [Академия Google]
Wright A.-D.G., Lynn D.H. Монофилия трихостомных инфузорий (Phylum Ciliophora: Class Litostomatea), протестированная с использованием новых последовательностей 18S рРНК из вестибулиферид, Isotricha кишечные и Dasytricha ruminantium , и hap ториан, Didinium nasutum . Евро. Дж. Протистол. 1997; 33: 305–315. [Google Scholar]
Райт А.-Д.Г., Линн Д.Х. Филогенетический анализ инфузорий рубца семейства Ophryoscolecidae на основе последовательностей 18S рибосомной РНК с новыми последовательностями из Диплодиний , Эудиплодиний и Офриосколекс . Может. Дж. Зул. 1997; 75: 963–970. [Google Scholar]
Райт А.-Д.Г., Дехорити Б.А., Линн Д.Х. Филогения инфузорий рубца последовательности малых субъединиц рибосомной РНК. Дж. Эукариот. микробиол. 1997; 44:61–67. [PubMed] [Google Scholar]
Wrześniowski A. Beobachtungen über Infusorien aus der Umgebung von Warschau.