Страница не найдена

  • ЯрГУ
    • История
    • Сведения об образовательной организации
    • Попечительский совет
    • Ученый совет
    • Ректорат
    • Подразделения
    • Сотрудникам
    • Выпускникам
    • Студентам
    • Основные документы
    • Телефонный справочник
    • Фонд целевого капитала
    • Рейтинги
  • Приоритет 2030
  • Программа развития
    • О программе ЯрГУ
    • Цифровые кафедры
    • Проекты
    • Документы
    • Новости
  • Абитуриенту
    • Бакалавриат и специалитет
    • Магистратура
    • Аспирантура
    • Среднее профессиональное образование
    • Памятка абитуриенту
    • Памятка иностранному абитуриенту
    • Контакты приемной комиссии
    • Основные документы
  • Образование
    • Приемная комиссия
    • Дополнительное образование детей
    • Среднее профессиональное образование
    • Высшее образование
    • Дополнительное образование
    • Университетская жизнь
    • Государственная аккредитация
    • Электронное обучение
  • Факультеты
  • Наука
  • Пресс-Центр
    • #МыВМЕСТЕ
    • Новости
    • События
    • Информационные издания
    • О нас
    • Центр университетского телевидения
    • Ресурсы ЯрГУ
    • Обратная связь
    • Для СМИ
    • Фотогалерея
    • Видеогалерея
  • Выборы ректора 2023
  • Контакты

Euglena gracilis Геном и транскриптом: органеллы, стратегии сборки ядерного генома и начальные признаки Джеймс Т.

Ю., Карпов С., Кугренс П., Круг Дж., Лейн К.Э., Льюис Л.А., Лодж Дж., Линн Д.Х., Манн Д.Г., Маккорт Р.М., Мендоз Л., Моеструп О., Мозли-Стэндридж С.Е., Нерад Т.А., Ширер К.А., Смирнов А.В., Spiegel FW, Taylor MFJR (2005) Новая классификация эукариот более высокого уровня с упором на таксономию протистов. Дж Эукариот микробиол 52:399–451

Перекрёстная ссылка пабмед Google Scholar

  • Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Макманус Х., Митчелл Э.А., Мозли-Стэнридж С.Е., Парфри Л.В., Павловски Дж., Рюкерт С., Шедвик Р.С., Шох К.Л., Смирнов А., Шпигель Ф.В. (2012) Пересмотренная классификация эукариот. J Eukaryot Microbiol 59(5):429–493

    Google Scholar

  • Аттарди Г., Шац Г. (1988) Биогенез митохондрий. Annu Rev Cell Biol 4:289–333

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Айкут А. О., Атилган А.Р., Атилган С. (2013) Разработка моделирования молекулярной динамики для изменения популяций конформационных состояний кальмодулина. PLoS Comput Biol 9(12):e1003366. doi: 10.1371/журналpcbi1003366

    Перекрёстная ссылка пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Bachvaroff TR, Sanchez Puerta MV, Delwiche CF (2005) Взаимоотношения пластид, содержащих хлорофилл c, основаны на анализе набора мультигенных данных со всеми четырьмя хромальвеолатными линиями. Мол Биол Эвол 22:1772–1782

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Берриман М., Гедин Э., Герц-Фаулер С., Бландин Г., Рено Х., Бартоломеу Д.С., Леннард Н.Дж., Калер Э., Хэмлин Н.Е., Хаас Б., Беме У., Ханник Л., Аслетт М.А., Шаллом Дж., Марчелло Л. , Хоу Л., Уикстед Б., Алсмарк Калифорнийский университет, Эрроусмит С., Аткин Р.Дж., Бэррон А.Дж., Бринго Ф., Брукс К., Кэррингтон М. , Черевач И., Чиллингворт Т.Дж., Черчер С., Кларк Л.Н., Кортон Ч.Х., Кронин А., Дэвис Р.М., Доггетт Дж., Джикенг А., Фельдблюм Т., Филд М.С., Фрейзер А., Гудхед И., Ханс З., Харпер Д., Харрис Б.Р., Хаузер Х., Хостетлер Дж., Ивенс А., Ягелс К., Джонсон Д., Джонсон Дж., Джонс К., Керхорну А.С., Ку Х., Ларке Н., Ландфир С., Ларкин С., Пиявка В., Лайн А, Лорд А., Маклеод А., Муни П.Дж., Мул С., Мартин Д.М., Морган Г.В., Мунгалл К., Норбертчак Х., Ормонд Д., Пай Г., Пикок С.С. , Петерсон Дж., Куэйл М.А., Раббинович Э., Раджандрим М.А., Рейтер С., Зальцберг С.Л., Сандерс М., Шобель С., Шарп С., Симмондс М., Симпсон А.Дж., Таллон Л., Тернер С.М., Тейт А., Тиви А.Р., Ван Акен С., Уокер Д., Ванлесс Д., Ван С., Уайт Б., Уайт О., Уайтхед С., Вудворд Дж., Вортман Дж., Адамс М.Д., Эмбли Т.М., Галл К., Уллу Э., Барри Д.Д., Фэрламб А.Х., Оппердоус Ф., Баррелл Б.Г., Донельсон Д.Э. , Hall N, Fraser CM, Melville SE, El-Sayed NM (2005)Геном африканской трипаносомы Trypanosoma brucei. Наука 309(5733):416–422

    КАС пабмед Google Scholar

  • Boetzer M, Henkel CV, Jansen HJ, Butler D, Pirovano W (2011) Предварительно собранные строительные леса с использованием SSPACE.

    Биоинформатика 27(4):578–579

    Google Scholar

  • Bolger AM, Lohse M, Usade B (2014) Trimmomatic: гибкий триммер для данных последовательностей Illumina. Биоинформатика 30(15):2114–2120

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Bolte K, Bullmann L, Hempel F, Bozarth A, Zauner S, Maier U (2009)Направление белков во вторичные пластиды. J Eukaryot Microbiol 56(1):9–15

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Buetow DE (1982) Биология эвглены, том III. Академик, Нью-Йорк

    Google Scholar

  • Bumbulis MJ, Balog BM (2013) Воздействие УФ-C вызывает процесс, подобный апоптозу, у Euglena gracilis. ISRN Cell Biol 2013 (869216): 6 страниц

    Google Scholar

  • Burger G, Lang BF, Reith M, Gray MW (1996) Гены, кодирующие одни и те же три субъединицы дыхательного комплекса II, присутствуют в митохондриальной ДНК двух филогенетически далеких эукариот. Proc Natl Acad Sci U S A 93:2328–2332

    CrossRef Google Scholar

  • Canaday J, Tessier L, Imbault HP, Paulus F (2001) Анализ генов тубулина Euglena gracilis альфа-, бета- и гамма: интроны и созревание пре-мРНК. Мол Генет Геномикс 265:153–160. дои: 10.1007/s004380000403

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Cook JR (1972) Ультрафиолетовая инактивация хлоропластов Euglena. I. Влияние освещенности культуры. Биофиз J 12:1467–1473

    перекрестная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Кук Дж. Р. (1981) Изменение уровней ДНК у эвглены в зависимости от рН культуральной среды. J Protozool 28:148–150

    Google Scholar

  • Кук Дж. Р., Роксби Р. (1985) Физические свойства плазмидоподобной ДНК Euglena gracilis. Биохим Биофиз Акта 824(80):83

    Google Scholar

  • Дайкер В., Леберт М., Рихтер П., Хадер Д. (2010) Молекулярная характеристика кальмодулина, участвующего в цепи передачи сигнала гравитаксиса у Euglena gracilis. Планта 231: 1229–1236. дои: 10.1007/s00425-010-1126-9

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Davis EA, Epstein HT (1971) Некоторые факторы, контролирующие ступенчатое изменение количества органелл у Euglena gracilis. Разрешение ячейки опыта 65: 273–280

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Добакова Е., Флегонтов П., Скалицкий Т., Лукес Дж. (2015) Неожиданно обтекаемый митохондриальный геном эвгленозойского Euglena gracilis. Геном Биол Эвол 7(12):3358–3367. дои: 10.1093/gbe/evv229

    Перекрёстная ссылка пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Добелл С (1932) Энтони ван Левенгук и его «маленькие животные»: что-то вроде описания отца протозоологии и бактериологии и его разнообразных открытий в этих дисциплинах. Констебль, Лондон, Великобритания. Перепечатано 1958 Рассел и Рассел, Нью-Йорк, Нью-Йорк, США

    Google Scholar

  • Dolezel J, Bartos J, Voglmayr H, Greilhuber J (2003) Ядерная ДНК и размер генома форели и человека. Цитометрия 51:127–128

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Dooijes D, Chaves I, Kieft R, Dirks-Mulder A, Martin W, Borst P (2000) Основание J, изначально обнаруженное в Kinetoplastida, также является второстепенным компонентом ядерной ДНК Euglena gracilis. Nucl Acids Res 28(16):3017–3021. Дои: 10.1093/нар/28163017

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Дос Сантос Феррейра В., Роккетта И., Конфорти В., Бенч С., Фельдман Р., Левин М.Дж. (2007) Паттерны экспрессии генов у Euglena gracilis: понимание клеточной реакции на стресс окружающей среды. Gene 389:136–145

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Эбель К., Франц К., Паулюс Ф., Имбо П. (1999) Транс- и цис-сплайсинг у бесцветного эвгленоида, Entosiphon sulcatum. Curr Genet 35: 542–550

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Эбенезер Т.Е., О’Нил Э., Золтнер М., Обадо С., Хэмпл В., Джинджер М., Джексон А., де Конинг Х., Люкс Дж., Дакс Дж., Леберт М., Кэррингтон М., Келли С., Филд М. и др. (2017) Комплемент и экспрессия генов у Euglena gracilis (в процессе подготовки)

    Google Scholar

  • Эль-Метвалли С., Хамза Т., Закария М., Хелми М. (2013) Сборка последовательности следующего поколения: четыре этапа обработки данных и вычислительные задачи. PLoS Comput Biol 9(12):1–19

    CrossRef Google Scholar

  • Epstein HT, Allaway E (1967) Свойства эвглены, подвергшейся избирательному голоданию. Biochim Biophys Acta 142:195–207

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Флегонтов П., Грей М.В., Бургер Г., Люкс Дж. (2011) Фрагментация генов: ключ к эволюции митохондриального генома у Euglenozoa? Карр Жене 57: 225–232. дои: 10.1007/s00294-011-0340-8

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Gibbs SP (1978) Хлоропласты Euglena, возможно, произошли от симбиотических зеленых водорослей. Can J Bot 56: 2883–2889

    CrossRef Google Scholar

  • Гнерре С., Маккаллум И., Пшибыльский Д., Рибейро Ф., Бертон Дж., Уокер Б., Шарп Т., Холл Г., Ши Т., Сайкс С., Берлин А., Эйрд Д., Костелло М., Даза Р., Уильямс Л., Николь R, Gnirke A, Nusbaum C, Lander ES, Jaffe DB (2011) Высококачественные черновые сборки геномов млекопитающих на основе массивно параллельных данных о последовательностях. Proc Natl Acad Sci USA 108(4):1513–1518

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Годикс М (1953) Род Euglena Madison. University of Wisconsin Press, Висконсин

    Google Scholar

  • Goto K, Beneragama CK (2010) Циркадные часы и замедление старения: раскрывают ли что-нибудь нестареющие микроводоросли, такие как Euglena? Aging Res Rev 9:91–100

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Грей М.В., Дулиттл В.Ф. (1982) Была ли доказана эндосимбионтная гипотеза? Микробиол Откр. 46:1–42

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Чайка К. (2001) Тубулины протистов: новые поступления, эволюционные отношения и понимание функции цитоскелета. Curr Opin Microbiol 4:427–432

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Гуревич А. , Савельев В., Вяхи Н., Теслер Г. (2013) QUAST: инструмент оценки качества сборки генома. Биоинформатика 29(8): 1072–1075. doi: 10.1093/биоинформатика/btt086

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Хадер Д.-П., Хеммерсбах Р., Леберт М. (2005a) Гравитация и поведение одноклеточных организмов. Издательство Кембриджского университета, Кембридж

    CrossRef Google Scholar

  • Хадер Д.-П., Хеммерсбах Р., Леберт М. (2005b) Гравитация и поведение одноклеточных организмов. Серия «Развитие и клеточная биология» (№ 40). Издательство Кембриджского университета, Кембридж

    Google Scholar

  • Hallick RB, Hong L, Drager RG, Favreau MR, Monfort A, Orsat B, Spielmann A, Stutz E (1993) Полная последовательность хлоропластной ДНК Euglena gracilis. Nucleic Acids Res 21:3537–3544

    CrossRef КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Hill HZ, Epstein HT, Schiff JA (1966) Исследования развития хлоропластов у Euglena. XIV. Последовательное взаимодействие ультрафиолетового света и фотореактивирующего света при формировании зеленых колоний. Биофиз J 6: 135–144

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Hornett EA, Wheat CW (2012) Количественный анализ RNA-Seq у немодельных видов: оценка сборок транскриптома в качестве каркаса и полезность эволюционно расходящихся геномных эталонных видов. Геномика BMC 13:361. дои: 10.1186/1471-2164-13-361

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Айвенс А.С., Пикок К.С., Уорти Э.А., Мерфи Л., Аггарвал Г., Берриман М., Сиск Э., Раджандрим М.А., Адлем Э., Аэрт Р., Анупама А., Апостолу З., Аттипо П., Бейсон Н., Баузер С., Бек А., Беверли С.М., Бианчеттин Г., Борзим К., Боте Г., Бруски К.В., Коллинз М., Кадаг Э., Чарлони Л., Клейтон К., Коулсон Р.М., Кронин А., Круз А. К., Дэвис Р.М., Де Гаудензи Дж., Добсон Д.Е., Дустерхофт А. , Фазелина Г., Фоскер Н., Фраш А.С., Фрейзер А., Фукс М., Габель С., Гобл А., Гоффо А., Харрис Д., Герц-Фаулер С., Гилберт Х., Хорн Д., Хуанг И., Клагес С., Найтс А., Кубе М. , Ларке Н., Литвин Л., Лорд А., Луи Т., Марра М., Масуй Д., Мэтьюз К., Михаэли С., Моттрам Дж. К., Мюллер-Ауэр С., Мунден Х., Нельсон С., Норбертчак Х., Оливер К., О’Нил С., Пентони М., Пол ТМ, Прайс С, Пурнелле Б., Куэйл М.А., Раббинович Э., Рейнхардт Р., Ригер М., Ринта Дж., Роббен Дж., Робертсон Л., Руис Дж.К., Раттер С., Сондерс Д., Шефер М., Шейн Дж., Шварц Д.С. , Сигер К., Сейлер А., Шарп С., Шин Х., Сивам Д., Квадраты Р., Квадраты С., Тосато В., Фогт С., Волкерт Г., Вамбатт Р., Уоррен Т., Ведлер Х., Вудворд Дж., Чжоу С., Циммерманн В., Смит Д.Ф., Блэквелл Дж.М., Стюарт К.Д., Баррелл Б., Майлер П.Дж. (2005)Геном кинетопластидного паразита Leishmania major. Наука 309(5733):436–442

    пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Джексон А. П., Воган С., Галл К. (2006)Эволюция массивов генов тубулина у трипаносоматидных паразитов: реструктуризация генома у Leishmania. BMC Genomics 7:261

    CrossRef пабмед ПабМед Центральный Google Scholar (2010) Последовательность генома Trypanosoma brucei gambiense, возбудителя хронического африканского трипаносомоза человека. PLoS Negl Trop Dis 4(4):e658

    Перекрёстная ссылка пабмед ПабМед Центральный Google Scholar (2016) Филогеномика кинетопластид выявляет эволюционные новшества, связанные с истоками паразитизма. Curr Biol 26:161–172

    CrossRef КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Kawasaki H, Kretsinger RH (1995) Белки, связывающие кальций 1: EF-руки. Белковый профиль 2(4):297–490

    CAS пабмед Google Scholar

  • Kim JT, Boo SM, Zakrys B (1998) Флористические и таксономические учеты рода Euglena (Euglenophyceae) из корейских пресных вод. Водоросли 13(2):173–197

    Google Scholar

  • Ламеш П., Берардини Т.З., Ли Д., Сварбрек Д., Уилкс С., Сасидхаран Р., Мюллер Р., Дрехер К., Александр Д.Л., Гарсия-Эрнандес М., Картикеян А.С., Ли Ч., Нельсон В.Д., Плетц Л., Сингх С. , Венсел А., Хуала Э. (2012) Информационный ресурс арабидопсиса (TAIR): улучшенная аннотация генов и новые инструменты. Нуклеиновые кислоты рез. 40:D1202–D1210

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Leedale GF (1958a) Митоз и число хромосом у Euglenineae (Flagellata). Природа 181(4607):502–503

    CrossRef Google Scholar

  • Leedale GF (1958b) Ядерная структура и митоз у Euglenineae. Arch Mikrobiol 32:32–64

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Leedale GF (1968) Ядро Euglena. В: Buetow DE (ред. ) Биология Эвглены. Academic, Нью-Йорк, стр. 185–272

    Google Scholar

  • Leedale GF (1974) Предварительные наблюдения по ядерной цитологии и ультраструктуре у Euglena gracilis, лишенного углерода и подвергнутого стрептомициновому обесцвечиванию. Colloq Int CNRS 240:285–290

    Google Scholar

  • Лефорт-Тран М., Бре М.Х., Пуфиль М., Маниго П. (1987) Проточная ДНК-цитометрия контрольной эвглены и блокада клеточного цикла дефицита витамина В12. Клеточная цитометрия 8:46–54

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Levasseur PJ, Meng Q, Bouck GB (1994)Тубулиновые гены у простейших водорослей Euglena gracilis. J Eukaryot Microbiol 41(5):468–477

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Linton EW, Karnkowska-Ishikawa A, Kim JI, Shin W, Bennett MS, Kwiatowski J, Zakrys B, Triemer RE (2010a) Реконструкция эвгленоидных эволюционных отношений с использованием трех генов: ядерных SSU и LSU и хлоропластных SSU последовательностей рДНК и описание Euglenaria gennov (Euglenophyta). Протисты 161: 603–619. doi: 10.1016/jprotis201002002

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Lonergan TA (1985) Регуляция формы клеток Euglena gracilis. IV. Локализация актина, миозина и кальмодулина. J Cell Sci 77:197–208

    CAS пабмед Google Scholar

  • Martin W, Herrmann RG (1998) Перенос генов из органелл в ядро: сколько, что происходит и почему? Растение Физиол 118:9–17

    Перекрестная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Mazus B, Falchuk KH, Vallee BL (1984) Образование гистонов, экспрессия генов и дефицит цинка у Euglena gracilis. Биохимия 23:42–47

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • McCormack E, Braam J (2003) Кальмодулины и связанные с ними потенциальные сенсоры кальция арабидопсиса. Новый Фитол 159:585–598

    Перекрёстная ссылка КАС Google Scholar

  • McDowall J (2016) «Кальмодулин» InterPro Protein Archive. По состоянию на 19 мая 2016 г.

    Google Scholar

  • McFadden GI (2001) Первичный и вторичный эндосимбиоз и происхождение пластид. J Phycol 37:951–959

    CrossRef Google Scholar

  • McKean PG, Vaughan S, Gull K (2001)Расширенное надсемейство тубулинов. J Cell Sci 114:2723–2733

    CAS пабмед Google Scholar

  • Милановский Р., Гуминьска Н., Карнковска А., Исикава Т., Закрысь Б. (2016) Промежуточные интроны в ядерных генах эвгленид — это отдельный тип? БМС Эвол Биол 16:49. дои: 10.1186/s12862-016-0620-5

    Перекрёстная ссылка пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Милановский Р. , Карнковска А., Исикава Т., Закрысь Б. (2014) Распределение обычных и нетрадиционных интронов в генах тубулина (α и β) эвгленид. Мол Биол Эвол 31(3):584–593

    Google Scholar

  • Morton BR (1998) Селекция по кодоновому смещению генов хлоропластов и цианелл в различных линиях растений и водорослей. J Mol Evol 46:449–459

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Morton BR (1999)Асимметрия нитей и систематическая ошибка использования кодонов в хлоропластном геноме Euglena gracilis. Proc Natl Acad Sci U S A 96(9):5123–5128

    Google Scholar

  • Nakazawa M, Inui H, Yamaji R, Yamamoto T, Takenaka S, Ueda M, Nakano Y, Miyatake K (2000) Происхождение пирувата: оксидоредуктаза NADP1 в ​​митохондриях Euglena gracilis. FEBS Lett 479:155–156

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Newton AC (2001) Протеинкиназа C: структурная и пространственная регуляция посредством фосфорилирования, кофакторов и макромолекулярных взаимодействий. Chem Rev 101:2353–2364

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Newton AC (2003) Регуляция киназ ABC путем фосфорилирования: протеинкиназа C как парадигма. Biochem J 370:361–371

    CrossRef КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Николенко С.И., Коробейников А.И., Алексеев М.А. (2013) BayesHammer: байесовская кластеризация для исправления ошибок при секвенировании отдельных клеток. BMC Genomics 14(1):S7

    CrossRef пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • O’Donnell EHJ (1965) Ядрышки и хромосомы Euglena gracilis. Cytologia 30(2):118–154

    CrossRef Google Scholar

  • O’Neil ST, Emrich SJ (2013) Оценка показателей сборки транскриптома De Novo на согласованность и полезность. BMC Genomics 14:465

    CrossRef пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • O’Neill EC, Trick M, Hill L, Rejzek M, Dusi RG, Hamilton CJ, Zimba PV, Henrissat B, Field RA (2015) Транскриптом Euglena gracilis обнаруживает неожиданные метаболические способности для биохимии углеводов и натуральных продуктов . Мол БиоСист 11:2808

    Перекрёстная ссылка пабмед Google Scholar

  • Парра Г., Брэднам К., Корф И. (2007) CEGMA: конвейер для точного аннотирования основных генов в геномах эукариот. Биоинформатика 23:1061–1067

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Perez E, Lapaille M, Degand H, Cilibrasi L, Villavicencio-Queijeiro A, Morsomme P, Gonzalez-Halphen D, Field MC, Remacle C, Baurain D, Cardol P (2014) Митохондриальная дыхательная цепь вторичного зеленая водоросль Euglena gracilis имеет много общих дополнительных субъединиц с паразитическими Trypanosomatidae. Митохондрия 19(Пт Б): 338–349. дои: 10.1016/jmito201402001

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Porterfield DM (1997) Ориентация подвижных одноклеточных водорослей на кислород: окситаксис у Euglena. Биол Булл 193:229–230

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Rawson JRY (1975) Характеристика ДНК Euglena gracilis по ее кинетике реассоциации. Биохим Биофиз Acta 402:171–178

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Ричардс О.К. (1967) Гибридизация хлоропласта Euglena gracilis и ядерной ДНК. Биохимия 57:156–163

    CAS Google Scholar

  • Розати Г., Верни Ф., Барсанти Л., Пассарелли В., Гуалтьери П. (1991) Ультраструктура апикальной зоны Euglena gracilis: фоторецепторы и двигательный аппарат. Электронная Микроск Версия 4:319–342

    Перекрестная ссылка КАС пабмед Google Scholar

  • Рой Дж., Фактороваб Д., Люкс Дж., Бургер Г. (2007) Необычные структуры митохондриального генома у Euglenozoa. Protist 158:385–396

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Schantz M, Schantz R (1989) Последовательность клона кДНК, кодирующего β-тубнлин из Euglena gracilis. Рез. нуклеиновых кислот 17(16):6727

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Schwartzbach SD, Schiff, JA (1983) Контроль пластогенеза у Euglena. В: Шропшир В. Младший, Мохор Х. (ред.) Энциклопедия физиологии растений, 6A. Новая серия, Springer, Берлин, стр. 312–335

    . Google Scholar

  • Симпсон Дж.Т., Дурбин Р. (2011) Эффективная сборка больших геномов de novo с использованием структур сжатых данных. Геном Res 22:549–556

    Перекрестная ссылка пабмед Google Scholar

  • Souza RT, Lima FM, Barros RM, Cortez DR, Santos MF, Cordero EM, Ruiz JC, Goldenberg S, Teixeira MMG, da Silveira JF (2011) Размер генома, полиморфизм кариотипа и хромосомная эволюция у Trypanosoma cruzi. PLoS One 6(8):e23042. doi: 10.1371/journalpone0023042

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Spencer DF, Gray MW (2011)Гены рибосомной РНК в митохондриальной ДНК Euglena gracilis: фрагментированные гены в, казалось бы, фрагментированном геноме. Mol Gen Genomics 285:19–31

    CrossRef КАС Google Scholar

  • Spencer DF, Gray MW (2012)Гены рибосомной РНК в митохондриальной ДНК Euglena gracilis: фрагментированные гены в, казалось бы, фрагментированном геноме. Mol Genet Genomics 285:19–31

    CrossRef Google Scholar

  • Станкевич А.Дж., Фальчук К.Х., Валле Б.Л. (1983) Состав и структура дефицитного цинка хроматина Euglena gracilis. Биохимия 22:5150–5156

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Стреб К., Рихтер П., Нтефиду М., Леберт М., Хадер Д.-П. (2002) Сенсорная трансдукция гравитации у Euglena gracilis. J Plant Physiol 159:855–862

    CrossRef КАС Google Scholar

  • Томпсон М.Д., Копертино Д.В., Томпсон Э., Фавро М.Р., Халлик Р.Б. (1995) Доказательства позднего происхождения интронов в хлоропластных генах из эволюционного анализа рода Euglena. Рез. нуклеиновых кислот 23(23):4745–4752

    Google Scholar

  • Toda H, Yazawa M, Yagi K (1992) Аминокислотная последовательность кальмодулина из Euglena gracilis. Eur J Biochem 205:653–660

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Цаголофф А., Майерс А.М. (1986) Генетика митохондриального биогенеза. Annu Rev Biochem 55:249–285

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Валле Б.Л., Фальчук К.Х. (1981) Цинк и экспрессия генов. Philos Trans R Soc Lond B 1(294):185–196

    CrossRef Google Scholar

  • Walker BJ, Abeel T, Shea T, Priest M, Abouelliel A, Sakthikumar S, Cuomo CA, Zeng Q, Wortman J, Young SK, Earl AM (2014) Pilon: интегрированный инструмент для всестороннего обнаружения микробных вариантов и улучшение сборки генома. ПЛОС Один 9(11): е112963

    Google Scholar

  • Wiegert KE, Bennett MS, Triemer RE (2012) Эволюция генома хлоропластов у фотосинтезирующих эвгленоидов: сравнение Eutrepta viridis и Euglena gracilis (Euglenophyta). Protist 163:832–843

    CrossRef КАС пабмед Google Scholar

  • Yoon HS, Hackett JD, Bhattacharya D (2002) Единое происхождение пластид, содержащих перидинин и фукоксантин, у динофлагеллят посредством третичного эндосимбиоза. Proc Natl Acad Sci U S A 99:11724–11729

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Закрыс Б. (1988) Уровень ядерной ДНК как потенциальный таксономический признак Euglena EHR (Euglenophyceae). Алгол Стад 49: 483–504

    Google Scholar

  • Закрыс Б., Уолн П.Л. (1994) Флористические, таксономические и фитогеографические исследования зеленых Euglenophyta с юго-востока США с упором на новые и редкие виды. Алгол Стад 72: 71–114

    Google Scholar

  • Zakryś B (1986) Вклад в монографию польских представителей рода Euglena Ehrenberg 1830. Nova Hedwig Beih 42: 491–540

    Google Scholar

  • Zhang T, Zhang X, Hu S, Yu J (2011) Эффективная процедура сборки генома органеллы растений на основе данных о полном геноме с платформы секвенирования 454 GS FLX. Методы растений 7:38

    Перекрёстная ссылка КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Скачать ссылки

    Трехмерная реконструкция органоидов Euglena gracilis Z. II. Качественные и количественные изменения хлоропластов и митохондриального ретикулума в синхронных культурах при обесцвечивании | Journal of Cell Science

    Пропустить пункт назначения

    СТАТЬЯ В ЖУРНАЛЕ| 01 декабря 1980

    М. Пеллегрини

    Информация об авторе и статье

    Онлайновый ISSN: 1477-9137

    Печатный ISSN: 0021-9533

    (1980) 46 (1): 313–340.

    https://doi.org/10.1242/jcs.46.1.313

    • Разделенный экран
    • Взгляды
      • Содержание артикула
      • Рисунки и таблицы
      • Видео
      • Аудио
      • Дополнительные данные
      • Экспертная оценка
    • Открой PDF для в другом окне
    • Делиться
      • Фейсбук
      • Твиттер
      • LinkedIn
      • Электронная почта
    • Инструменты
      • Получить разрешения

      • Иконка Цитировать Цитировать

    • Поиск по сайту

    Цитата

    М. Пеллегрини; Трехмерная реконструкция органелл Euglena gracilis Z. II. Качественные и количественные изменения хлоропластов и митохондриального ретикулума в синхронных культурах при обесцвечивании. J Cell Sci 1 декабря 1980 г.; 46 (1): 313–340. doi: https://doi.org/10.1242/jcs.46.1.313

    Скачать файл цитаты:

    • Ris (Zotero)
    • Менеджер ссылок
    • EasyBib
    • Подставки для книг
    • Менделей
    • Бумаги
    • КонецПримечание
    • РефВоркс
    • Бибтекс
    панель инструментов поиска

    Расширенный поиск

    С помощью ультратонких серийных срезов у ​​Euglena gracilis Z при отбеливании в темноте с добавлением ацетата натрия в культуральную среду наблюдались морфологические и объемные изменения пластидома и хондриома. Чтобы не вносить никаких изменений в картину синхронизации при обесцвечивании, зеленые клетки предварительно выращивали фотоавтотрофно на среде Крамера и Майерса при непрерывном освещении и синхронизировали циклами температуры и (2) ацетата натрия и темноты на пластидоме и хондриоме фотоавтотрофных клеток. синхронизированы циклами свет-темнота, как описано ранее. У фотоавтотрофных клеток пластидом, состоящий примерно из десяти дискоидальных хлоропластов, занимает 15% объема клетки. Хондриом в виде одной гигантской митохондрии, разветвленной по всей клетке, составляет 6% объема клетки. Синхронизация циклами температуры при непрерывном освещении не изменяет морфологию и объем этих органелл. Однако пиреноиды исчезают. В фотогетеротрофной культуре с добавлением ацетата натрия тонкая структура пластидома не изменяется, но его объем уменьшается на 19–25%. Таким образом, в это время пластидом занимает 12–13% объема клетки. Ацетат натрия вызывает, напротив, гипертрофию тонких нитей митохондриального ретикулума, который выглядит как сеть с узкими ячейками вокруг других органелл. Таким образом, хондриом занимает 10–11% объема клетки. В гетеротрофных клетках комбинированное воздействие ацетата натрия и темноты подчеркивает регрессию пластидома, в то время как хондриом выглядит как фенестрированная париетальная оболочка, занимающая 15-16% объема клетки.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *