Установка механизмов блюм: Монтаж и регулировка AVENTOS HF

Механизм сборки комплекса синдрома Блума, необходимый для растворения двойного соединения Холлидея и стабильности генома

. 2022 г., 8 февраля; 119(6):e2109093119.

doi: 10.1073/pnas.2109093119.

Шарлотта Ходсон ¹ , Джейсон К К Лоу ² , Сильви ван Твест ¹ , Сэмюэл Э. Джонс ³ , Паоло Суэк ⁴ , Винсент Мерфи ¹ , Кайма Цукада ^{3 5} , Мэтью Фоукс ^{3 6} , Рохан Байтелл-Дуглас ^{1 7} , Аделина Дэвис ⁴ , Джессика К Холиен ^{7 8 9}

, Жюльен Дж. О’Рурк ¹ , Бенджамин Л. Паркер ² , Астрид Глейзер ¹ , Майкл Паркер ^{9 10} , Джоэл П. Маккей ² , Эндрю Н. Блэкфорд ^{3 6} , Алессандро Коста ⁴ , Эндрю Дж. Динс ^{11 7}

Принадлежности

• ¹ Отделение стабильности генома, Институт медицинских исследований Св. Винсента, Фицрой, Виктория 3065, Австралия.
• ² Школа наук о жизни и окружающей среде Сиднейского университета, Сидней, Новый Южный Уэльс, 2006 г. , Австралия.
• ³ Отделение онкологии, Институт молекулярной медицины MRC Weatherall, Оксфордский университет, больница Джона Рэдклиффа, Оксфорд OX3 9DS, Соединенное Королевство.
• ⁴ Институт Фрэнсиса Крика, Лондон, NW1 1AT, Великобритания.
• ⁵ Лаборатория безуглеродной энергетики Института инновационных исследований Токийского технологического института, Токио 152-8550, Япония.
• ⁶ MRC Оксфордский институт радиационной онкологии, кафедра онкологии, Оксфордский университет, Оксфорд OX3 7DQ, Соединенное Королевство.
• ⁷ Медицинский факультет (Сент-Винсент), Мельбурнский университет, Фицрой, Виктория 3065, Австралия.
• ⁸ Научная школа, Университет RMIT, Мельбурн, Виктория 3001, Австралия.
• ⁹ Отдел структурной биологии, Институт медицинских исследований Св. Винсента, Фицрой, Виктория 3065, Австралия.
• ¹⁰ Институт Bio21, Университет Мельбурна, Парквилл, Виктория 3010, Австралия.
• ¹¹ Отделение стабильности генома, Институт медицинских исследований Св. Винсента, Фицрой, Виктория 3065, Австралия; [email protected].

• PMID: 35115399
• PMCID: PMC8832983
• DOI: 10. 1073/пнас.2109093119

Бесплатная статья ЧВК

Шарлотта Ходсон и соавт. Proc Natl Acad Sci U S A. 2022 .

Бесплатная статья ЧВК

. 2022 г., 8 февраля; 119(6):e2109093119.

doi: 10.1073/pnas.2109093119.

Авторы

Шарлотта Ходсон ¹ , Джейсон К К Лоу ² , Сильви ван Твест ¹ , Сэмюэл Э. Джонс ³ , Паоло Суэк ⁴ , Винсент Мерфи ¹ , Кайма Цукада ^{3 5} , Мэтью Фоукс ^{3 6} , Рохан Байтелл-Дуглас ^{1 7} , Аделина Дэвис ⁴ , Джессика К Холиен

7 8 9 , Жюльен Дж. О’Рурк ¹ , Бенджамин Л. Паркер ² , Астрид Глейзер ¹ , Майкл Паркер ^{9 10} , Джоэл П. Маккей ² , Эндрю Н. Блэкфорд ^{3 6} , Алессандро Коста ⁴ , Эндрю Дж. Динс ^{11 7}

Принадлежности

• 1 Отделение стабильности генома, Институт медицинских исследований Св. Винсента, Фицрой, Виктория 3065, Австралия.
• ² Школа наук о жизни и окружающей среде Сиднейского университета, Сидней, Новый Южный Уэльс, 2006 г. , Австралия.
• ³ Отделение онкологии, Институт молекулярной медицины MRC Weatherall, Оксфордский университет, больница Джона Рэдклиффа, Оксфорд OX3 9DS, Соединенное Королевство.
• ⁴ Институт Фрэнсиса Крика, Лондон, NW1 1AT, Великобритания.
• ⁵ Лаборатория безуглеродной энергетики Института инновационных исследований Токийского технологического института, Токио 152-8550, Япония.
• ⁶ MRC Оксфордский институт радиационной онкологии, кафедра онкологии, Оксфордский университет, Оксфорд OX3 7DQ, Соединенное Королевство.
• ⁷ Медицинский факультет (Сент-Винсент), Мельбурнский университет, Фицрой, Виктория 3065, Австралия.
• ⁸ Научная школа, Университет RMIT, Мельбурн, Виктория 3001, Австралия.
• ⁹ Отдел структурной биологии, Институт медицинских исследований Св. Винсента, Фицрой, Виктория 3065, Австралия.
• ¹⁰ Институт Bio21, Мельбурнский университет, Парквилл, Виктория 3010, Австралия.
• ¹¹ Отделение стабильности генома, Институт медицинских исследований Св. Винсента, Фицрой, Виктория 3065, Австралия; [email protected].

• PMID: 35115399
• PMCID: PMC8832983
• DOI: 10. 1073/пнас.2109093119

Абстрактный

RecQ-подобная геликаза BLM взаимодействует с топоизомеразой IIIα, RMI1 и RMI2 в гетеротетрамерном комплексе («комплекс синдрома Блума») для растворения двойных соединений Холлидея, ключевых промежуточных продуктов гомологичной рекомбинации. Мутации в любом компоненте комплекса синдрома Блума могут вызвать нестабильность генома и очень склонное к раку расстройство, называемое синдромом Блума. Некоторые гетерозиготные носители также предрасположены к раку молочной железы. Чтобы понять, как связаны активности хеликазы BLM и топоизомеразы IIIα, мы очистили активный комплекс из четырех субъединиц. Химическая сшивка и масс-спектрометрия выявили уникальную архитектуру, которая связывает домены геликазы и топоизомеразы. Используя биохимические эксперименты, мы продемонстрировали димеризацию, опосредованную N-концом BLM со стехиометрией 2: 2: 2: 2 в комплексе синдрома Блума.

Мы идентифицировали мутации, которые независимо отменяют димеризацию или ассоциацию BLM с RMI1, и мы показываем, что обе они дисфункциональны для растворения с использованием анализов in vitro и вызывают нестабильность генома и синтетические летальные взаимодействия с GEN1/MUS81 в клетках. Укороченный BLM может также ингибировать активность полноразмерного BLM в смешанных димерах, указывая на предполагаемый механизм доминантно-негативного действия у носителей аллелей усечения BLM. Наши результаты идентифицируют критические молекулярные детерминанты сборки комплекса синдрома Блума, необходимого для растворения двойного соединения Холлидея и поддержания стабильности генома.

Ключевые слова: геликаза; комплекс Блума; масс-спектрометрия перекрестных связей; стабильность генома; топоизомераза.

Copyright © 2022 Автор(ы). Опубликовано ПНАС.

Заявление о конфликте интересов

w3.org/1999/xlink» xmlns:mml=»http://www.w3.org/1998/Math/MathML» xmlns:p1=»http://pubmed.gov/pub-one»> Заявление о конкурирующих интересах: A.J.D. является получателем финансирования исследований от Tessellate Biosciences и Pfizer, не связанного с представленной работой. Эти компании не имели никакого влияния на содержание рукописи.

Цифры

Рис. 1.

Очистка стехиометрических, стабильных и…

Рис. 1.

Очистка стехиометрического, стабильного и активного рекомбинантного комплекса БС. ( А и Б…

Рисунок 1.

Очистка стехиометрического, стабильного и активного рекомбинантного комплекса БС. ( A и B ) Стратегия очистки и окрашивание Кумасси синим SDS-PAGE (электрофорез в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия) гели рекомбинантного комплекса BS, включая вестерн-блоты для указанных белков. ( C ) ДНК-связывающие EMSA комплекса BS (BTRR) по сравнению с BLM без комплекса (TRR). EMSA выполняли с различными структурами олигонуклеотидной ДНК, изображенными на схеме рядом с соответствующей авторадиограммой. ( D ) Схема анализа растворения dHJ и продуктов миграции конвергентных ветвей с помощью рекомбинантного комплекса Блума (BTRR) и комплекса без BLM (TRR) в присутствии или в отсутствие АТФ.

Рис. 2.

Контактные точки внутри БС…

Рис. 2.

Точки контакта внутри комплекса BS, выявленные с помощью связанной масс-спектрометрии сшивки. (…

Рис. 2.

Точки контакта внутри комплекса BS, выявленные с помощью связанной масс-спектрометрии сшивки. ( A ) Гель комплекса BS, окрашенный рубином Sypro, до сшивания с помощью DSS (дорожка 2) и после обработки (дорожка 3). ( B ) Пример данных о перекрестных связях и ( C ) распределения длин сшитых пептидов при отображении на доступные кристаллические структуры. ( D ) Схема комплекса BS с картированными сшитыми пептидами. Черные линии представляют внутренние перекрестные связи. Взаимные связи представлены красными линиями. ( E и F ) Пример картирования поперечных связей на кристаллических структурах MBP (идентификационный код PDB 1MPD) и TopoIIIα:RMI1 (идентификационный код PDB 4CHT). Синие и красные линии представляют поперечные связи <33,4- и >33,4-Å отсечки соответственно. NTD, аминоконцевые домены; имп/мин, отсчетов на массу; m/z, масса/заряд.

Рис. 3.

BLM представляет собой димер внутри…

Рис. 3.

BLM представляет собой димер в комплексе Блума и изолированно. ( А…

Рис. 3.

BLM представляет собой димер в комплексе Блума и изолированно. ( A ) Поперечные связи, нанесенные на мономер ( Левый ) или димер ( Правый ) BLM (идентификационный код PDB 4O3M). Синие и красные линии представляют поперечные связи <33,4- и >33,4-Å отсечки соответственно. ( B ) Нативный гель PAGE показывает преобладающую полосу с молекулярной массой более 500 кДа, соответствующую интактному комплексу Блума с большей, чем его предсказанная молекулярная масса. ( C ) Совместная очистка MBP-BLM, содержащего комплекс Блума, показывает, что дополнительные копии Flag-BLM присутствуют в элюциях мальтозы. Показан окрашенный кумасси SDS-PAGE с компонентами диссольвасомы HJ. ( D ) Совместная очистка MBP-BLM и Flag-BLM в отсутствие других компонентов комплекса Блума. IN представляет собой входной продукт очистки амилозы, где указаны молярно-нормированные (1,25-кратный коэффициент, основанный на разнице в размерах между двумя белками) MBP-Blm и Flag-BLM, окрашенные кумасси синим. После второй аффинной очистки на смоле anti-Flag соотношение между MBP-BLM и Flag-BLM теперь приблизительно равно единице. Показаны планки погрешностей и значения из трех независимых повторов этого эксперимента. E1/2/3, элюирование флага; FT, проточный; W1/2, стирки.

Рис. 4.

N-концевой домен DHBN опосредует…

Рис. 4.

N-концевой домен DHBN опосредует димеризацию BLM. ( A ) Схема эволюционного…

Рис. 4.

N-концевой домен DHBN опосредует димеризацию BLM. ( А ) Схема эволюционной консервации геликазы BLM (144 гомолога позвоночных), показанная в соответствии с BLM человека и известными доменами. Усечения, используемые в этой рукописи, показаны ниже. DHBN, спиральный пучок димеризации на N-конце; HRDC, геликаза и С-конец РНКазыD; RB, область связывания RPA 1 или 2; RQC, RecQ C-конец; TB, область связывания TOPBP1; X1/2, консервативные мотивы неизвестной функции. ( B ) Вытягивание BLM-N630 или BLM-C640 с тегами MBP с помощью Flag-BLM. Top – гели SDS-PAGE, окрашенные кумасси синим. Средний и Нижний представляют собой анти-флаг (красный) и анти-MBP (зеленый) вестерн-блоты элюций и исходных материалов. Обратите внимание, что фрагменты BLM-N630 и BLM-C640 имеют одинаковый размер по вестерн-блоттингу. ( C ) SEC-MALS N-концевых фрагментов BLM; наложены профили BLM N1433 (черный) и BLM N163 (желтый). ( D ) Кристаллическая структура домена DHBN BLM (идентификационный код PDB 5LUP), показывающая, что две молекулы BLM (красная и бежевая) образуют интерфейс димеризации. Боковые цепи на интерфейсе показаны желтым цветом и показаны путем выравнивания последовательностей, чтобы сохраниться в эволюции. ( E ) Указанный «мутант-участок» в C при клонировании в полноразмерный MBP-BLM не соосаждается с Flag-BLM. ( F ) Мутант BLM N433 PATCH является мономерным по данным SEC-MALS. WT, дикий тип.

Рис. 5.

Консервативный N-концевой мотив в…

Рис. 5.

Консервативный N-концевой мотив в BLM опосредует ассоциацию TopoIIIα:RMI1:RMI2, независимую от димеризации BLM.…

Рис. 5.

Консервативный N-концевой мотив в BLM опосредует ассоциацию TopoIIIα:RMI1:RMI2, независимую от димеризации BLM. ( A и B ) Элюции от коиммунопреципитации комплекса Flag-RMI1:RMI2:TopoIIIα с BLM N630 или C640 полноразмерного BLM ^WT или BLM ^PATCH . ( C ) Массив перекрывающихся пептидов BLM _1–120 . Пятно 1 = BLM _1–20 , пятно 2 = BLM _2–21 и т. д. инкубировали с MBP ( Верхний ) или HisSUMO-RMI _1–213 ( Нижний ), а затем зондировали антителом против MBP. ( D ) Матрица замещающих пептидов. Каждая аминокислота (столбцы) BLM _27–46 заменена (ряд 1) лейцином, (ряд 2) глицином, (ряд 3) аргинином или (ряд 4) глутаматом. Под массивом находится выравнивание BLM _27–46 человека, мыши ( Mus musculus) или лягушки ( Xenopus laevis) плюс логотип мотива из 144 гомологов позвоночных. Выделена консервативная последовательность FTF и указан мутант, использованный в экспериментах. ( E ) Эксперимент по вытягиванию с рекомбинантным BLM и фрагментами RMI1 дикого типа (WT) или мутантными (FTF>GGG). ( F ) Пример экспериментов по поляризации флуоресценции, выполненных с использованием BLM _27–46 или BLM _27–46 ^{FTF > GGG} и RMI _1–213 .

Рис. 6.

Димеризация BLM требуется для…

Рис. 6.

Для растворения dHJ требуется димеризация BLM, но не хеликазная активность BS…

Рис. 6. Для растворения dHJ необходима димеризация

BLM, но не хеликазная активность комплекса BS. ( A ) Анализ хеликазы в реальном времени белков дикого типа и PATCH (мутант с дефектом димеризации) BLM. АТФ вводили в указанный момент времени. ( B ) Пример результата анализа dHJ (30 мин) анализа растворения с диким типом, PATCH, FTF > GGG или K69Белки 5T BLM вместе с комплексом TopoIIIα:RMI1:RMI2. ( C ) Эксперимент с динамикой во времени, показывающий ход растворения в среднем из трех экспериментов с MBP-BLM или MBP-BLM-PATCH вместе с комплексом TopoIIIα::RMI1:RMI2. ( D ) Пример анализа dHJ (30 мин) с использованием Flag-BLM в комплексе с MBP-BLM дикого типа или MBP-BLM-N630 вместе с комплексом TopoIIIα::RMI1:RMI2. Графики трех независимых экспериментов ± SEM показаны под каждым примером в B и 9.0249 Д . WT, дикий тип.

Рис. 7.

Димеризация BLM и ассоциация RMI1…

Рис. 7.

Димеризация BLM и ассоциация RMI1 необходимы для стабильности генома в клетках. (…

Рис. 7. Димеризация

BLM и ассоциация RMI1 необходимы для стабильности генома в клетках. ( A ) Вестерн-блоты клеток BLM ^+/+ и BLM ^-/- RPE-1, дополненных вариантами GFP или GFP-BLM. ( B ) Коиммунопреципитация из клеток, трансфицированных вариантами GFP-BLM. ( C ) Репрезентативные митотические хромосомы и ( D ) количественная оценка SCE / митоза. Столбики погрешностей указывают SD. ( E ) Анализ выживания колоний с использованием клеток RPE-1 BLM ^+/+ и BLM ^-/- , дополненных вариантами GFP или GFP-BLM и трансфицированных контрольными или MUS81/GEN1 siRNA. Столбики погрешностей указывают SEM. ( F ) Примеры нормальных и сегментированных хромосом из клеток, обработанных как в E , и их количественная оценка. Столбики погрешностей указывают SD. *** Р < 0,001, **** Р < 0,0001.

См. это изображение и информацию об авторских правах в PMC

Похожие статьи

• BLAP75/RMI1 способствует зависимому от BLM растворению промежуточных продуктов гомологичной рекомбинации.

  Ву Л., Бахрати Ч.З., Оу Дж., Сюй С., Инь Дж., Чанг М., Ван В., Ли Л., Браун Г.В., Хиксон И.Д. Ву Л и др. Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 14 марта; 103 (11): 4068-73. doi: 10.1073/pnas.0508295103. Epub 2006 6 марта. Proc Natl Acad Sci U S A. 2006. PMID: 16537486 Бесплатная статья ЧВК.

• Аберрантная морфология хромосом в клетках человека, дефектных для разрешения соединения Холлидея.

  Векслер Т., Ньюман С., Вест С.К. Векслер Т. и соавт. Природа. 2011 31 марта; 471 (7340): 642-6. дои: 10.1038/nature09790. Epub 2011 13 марта. Природа. 2011. PMID: 21399624 Бесплатная статья ЧВК.

• Активность обработки соединения Холлидея комплекса BLM-Topo IIIalpha-BLAP75.

  Буссен В., Рейнард С., Бусыгина В., Сингх А.К., Сунг П. Буссен В. и соавт. Дж. Биол. Хим. 2007 26 октября; 282 (43): 31484-92. doi: 10.1074/jbc.M706116200. Epub 2007 28 августа. Дж. Биол. Хим. 2007. PMID: 17728255

• Роль хеликазы синдрома Блума в поддержании стабильности генома.

  Cheok CF, Bachrati CZ, Chan KL, Ralf C, Wu L, Hickson ID. Чеок С.Ф. и соавт. Биохим Сок Транс. 2005 дек; 33 (часть 6): 1456-9. DOI: 10.1042/BST0331456. Биохим Сок Транс. 2005. PMID: 16246145 Обзор.

• Структурное руководство по комплексу синдрома Блума.

  Bythell-Douglas R, Deans AJ. Bythell-Douglas R, et al. Состав. 2021 4 февраля; 29 (2): 99-113. doi: 10.1016/j.str.2020.11.020. Epub 2020 22 декабря. Состав. 2021. PMID: 33357470 Обзор.

Посмотреть все похожие статьи

Цитируется

• Связанное с репликацией образование и репарация комплексов расщепления топоизомеразой IIIα человека.

  Саха Л.К., Саха С., Ян С., Хуан С.Н., Сунь Ю., Джо Ю., Поммье Ю. Саха Л.К. и др. Нац коммун. 2023 6 апреля; 14 (1): 1925. doi: 10.1038/s41467-023-37498-6. Нац коммун. 2023. PMID: 37024461 Бесплатная статья ЧВК.

• Реакция на повреждение ДНК и восстановление в бор-нейтронозахватной терапии.

  Мечетин Г.В., Жарков Д. О. Мечетин Г.В. и соавт. Гены (Базель). 2023 2 января; 14 (1): 127. doi: 10.3390/genes14010127. Гены (Базель). 2023. PMID: 36672868 Бесплатная статья ЧВК. Обзор.

• Комплекс MRN и топоизомераза IIIa-RMI1/2 синхронизируют моторные белки резекции ДНК.

  Soniat MM, Nguyen G, Kuo HC, Finkelstein IJ. Сониат М.М. и др. Дж. Биол. Хим. 2023 фев; 299(2):102802. doi: 10.1016/j.jbc.2022.102802. Epub 2022 16 декабря. Дж. Биол. Хим. 2023. PMID: 36529288 Бесплатная статья ЧВК.

Рекомендации

1. 1. Матос Дж., Бланко М.Г., Маслен С., Скехел Дж.М., Вест С.К., Регуляторный контроль разрешения промежуточных продуктов рекомбинации ДНК во время мейоза и митоза. Ячейка 147, 158–172 (2011). — ЧВК — пабмед
2. 1. Захариевич К. , Тан С., Ма Ю., Хантер Н., Очерчивание путей разрешения совместных молекул в мейозе идентифицирует перекрестно-специфическую резольвазу. Ячейка 149, 334–347 (2012). — ЧВК — пабмед
3. 1. Векслер Т., Ньюман С., Уэст С.К., Аберрантная морфология хромосом в клетках человека, дефектных для разрешения соединения Холлидея. Природа 471, 642–646 (2011). — ЧВК — пабмед
4. 1. Чан Ю. В., Фуггер К., Уэст С.К., Неразрешенные промежуточные продукты рекомбинации приводят к сверхтонким анафазным мостикам, разрывам хромосом и аберрациям. Нац. Клеточная биол. 20, 92–103 (2018). — ЧВК — пабмед
5. 1. Герман Дж., Синдром Блума. ХХ. Первые 100 раков. Рак Генет. Цитогенет. 93, 100–106 (1997). — пабмед

Типы публикаций

термины MeSH

вещества

Грантовая поддержка

• WT_/Wellcome Trust/Великобритания
• C29215/A20772/CRUK_/Cancer Research UK/Великобритания

Физические механизмы поглощения биологического углерода в начале весеннего цветения фитопланктона в северо-западной части Средиземного моря (участок БУССОЛЬ)

Альварес, М. , Санлеон-Бартоломе, Х., Танхуа, Т., Минтроп, Л., Лучетта А., Кантони К., Шредер К. и Чивитарезе Г.: CO ₂ система в Средиземном море: широкая перспектива бассейна, Ocean Sci., 10, 69–92, https://doi.org/10.5194/os-10-69-2014, 2014. 

Андерсен, В. и Приер, Л.: Одномесячное исследование в открытом северо-западном Средиземноморье. Море (эксперимент DYNAPROC, май 1995 г.): обзор гидробиогеохимических структуры и последствия ветровых явлений, Deep-Sea Res. Пт. я, 47, 397–422, 2000. 

Антуан, Д., Гевель, П., Десте, Ж.-Ф., Беку, Г., Луи, Ф., Скотт, А.Дж., и Бардей, П.: Буй «БУССОЛЬ»; новый прозрачно-набухший тугой швартовка для морской оптики: дизайн, испытания и работа в море, Дж. Атмос. Океан. техн., 25, 968–989, 2008а.

Антуан Д., д’Ортенцио Ф., Хукер С. Б., Беку Г., Джентили Б., Тайльез, Д., и Скотт, А.Дж.: Оценка неопределенности в океане коэффициент отражения, определяемый тремя спутниковыми датчиками цвета океана (MERIS, SeaWiFS и MODIS-A) на морской площадке в Средиземном море (BOUSSOLE проект), Ж. Геофиз. Рез., 113, CO7013, https://doi.org/10.1029/2007JC004472, 2008b.

Антуан Д.М., Шами Х., Клаустр Ф., Д’Ортензио А., Морель Г., Беку Б., Джентили Ф., Луис Дж., Рас Э., Руссье А.Дж., Скотт Д., Тайльез С.Б., Хукер, П., Гевель, Ж.-Ф., Десте, К., Демпси, К., и Адамс, Д.: БУССОЛЬ: совместная калибровка цвета океана CNRS-INSU, ЕКА, CNES и НАСА и Деятельность по валидации, Технический меморандум НАСА, №. ТМ-2006-214147, NASA/GSFC, Гринбелт, США, Национальное управление по аэронавтике и исследованию космического пространства, Вашингтон, округ Колумбия, 20546-0001, 2006 г. 

Бегович, М. и Копен-Монтегут, К.: Процессы, контролирующие годовые колебания при парциальном давлении f CO ₂ в поверхностных водах центральной северо-западная часть Средиземного моря (участок Dyfamed), Deep-Sea Res. Пт. II, 49, 2031–2047, 2002. 

Беренфельд, М. и Босс, Э.: Возрождение экологических основ цветение океанского планктона, Энн. Rev. Mar. Sci., 6, 167–194, https://doi. org/10.1146/annurev-marine-052913-021325, 2014. 

Беренфельд, MJ: Отказ от гипотезы критической глубины Свердрупа на цветение фитопланктона, экология, 91, 977–989, 2010. 

Бутин, Дж. и Мерливат, Л.: Новые оценки in situ скорости биологического производства углерода в Южном океане на основе измерений дрифтеров CARIOCA, Geophys. Рез. Письма, 36, L13608, https://doi.org/10.1029/2009GL038307, 2009. 

Брейнерд, К. Э. и Грегг, М. К.: Смешанная поверхность и глубина слоя смешения. Глубоководные рез. Пт. I, 42, 1521–1543, 1995. 

Броди, С. и Лозьер, М.: Изменения в доминирующей шкале длины микширования как движущая сила инициации цветения фитопланктона в Северной Атлантике // Геофиз. Рез. Летт., 41, 3197–3206, 2014. 

Броуди, С. Р. и Лозьер, М. С.: Характеристика смешения верхних слоев океана и его влияние на весеннее цветение фитопланктона по данным in situ, ICES J. мар. наук, 72, 1961–1970, 2015. 

Чизвелл, С. М.: Годовые циклы и весеннее цветение фитопланктона: не полностью отказаться от Свердрупа, мар. экол. прог. сер., 443, 39–50, 2011. 

Копен-Монтегут, К. и Бегович, М.: Распределение свойств карбонатов и кислорода по толщине воды (0–2000 м) в центральной части СЗ Средиземное море (сайт Dyfamed), Влияние зимнего вертикального перемешивания на воздух-море CO 9обмены 0403 2 и O ₂ , Deep-Sea Res. Пт. 2, 49, 2049–2066, 2002. 

Копен-Монтегу, К., Бегович, М. и Мерливат, Л.: Изменчивость парциальное давление CO ₂ в дневной и годовой шкале времени в Северо-Западном Средиземное море, Mar. Chem., 85, 169–189, 2004. 

Коппола Л., Лежандр Л., Лефевр Д., Приер Л., Тайландье В. и Рикье, Э. Д.: Сезонные и межгодовые вариации растворенного кислорода в северо-запад Средиземного моря (сайт DYFAMED), Prog. океаногр., 2018. 

Диксон, А. Г. и Миллеро, Ф. Дж.: Сравнение равновесия константы диссоциации угольной кислоты в морской среде, Deep-Sea Рез. Пт. А, 34, 1733–1743 1987. 

Энрикес, Р. М. и Тейлор, Дж. Р.: Численное моделирование соревнований между ветровым перемешиванием и нагревом поверхности в спусковой пружине цветение фитопланктона, ICES J. Mar. Sci. J. Cons., fsv071, 2015. 

Консорциум Globcolour ESA: https://www.globcolour.info, Globcolour [набор данных], https://hermes.acri.fr/, последний доступ: 18 июля 2022 г. 

Голбол М., Веллуччи В. и Антуан Д.: BOUSSOLE, https://doi.org/10.18142/1, 2000. 

Хемминг М. П., Кайзер Дж., Хейвуд К. Дж., Баккер , D.C.E., Boutin, J., Shitashima, K., Lee, G., Legge, O. и Onken, R.: Измерение изменчивости pH с помощью экспериментального датчика на подводном планере, Ocean Sci., 13, 427–442 , https://doi.org/10.5194/os-13-427-2017, 2017. 

Хольте, Дж. и Тэлли, Л.: Новый алгоритм определения глубины смешанных слоев с приложениями к данным Арго и субантарктическому режиму формирования воды, Дж. Атмос. Океан. Техн., 26, 1920–1939, 2009. 

Худ, Э. М. и Мерливат, Л.: Годовые и межгодовые вариации f CO ₂ in северо-западная часть Средиземного моря: результаты ежечасных измерений, сделанных CARIOCA buoys, 1995–1997, J. Mar. Res., 59, 113–131, 2001. Средиземное море) с pH /  p (CO ₂ ) Тестирование датчика ISFET, март–апрель 2016 г. NERC EDS Британский центр океанографических данных NOC, https://doi.org/10.5285/e686816f-8bdd-4782-e053- 6c86abc07adc, 2022. 

Лакур Л., Бриггс Н., Клаустр Х., Ардина М. и Далл’Олмо Г.: внутрисезонная динамика смешаннослойной помпы на приполярном севере Атлантический океан: подход с использованием биогеохимического флота Арго, Global Biogeochem. Cy., 33, 266–281, 2019. 

Lee, Z., Weidemann, A., Kindle, J., Arnone, R., Carder, K.L., and Davis, C.: Эвфотический глубина зоны: ее происхождение и значение для дистанционного зондирования цвета океана, Дж. Геофиз. Res.-Ocean., 112, https://doi.org/10.1029/2006JC003802, 2007. 

Махадеван, А., Д’асаро, Э., Ли, К., и Перри, М.Дж.: Управляемый вихрем стратификация инициирует весеннее цветение фитопланктона в Северной Атлантике, Наука, 337, 54–58, 2012. 

Марти, Ж.-К. и Кьяверини, Дж.: Сезонные и межгодовые колебания фитопланктон производство на станции временных рядов DYFAMED, северо-западная часть Средиземного моря, Глубоководные рез. Пт. II, 49, 2017–2030, 2002. 

Мербах, К., Калберсон, С. Х., Хоули, Дж. Э., и Пыткович, Р. М.: Измерение кажущихся констант диссоциации угольной кислоты в морская вода при атмосферном давлении, Limnol. океаногр., 18, 897–907, 1973. 

Мерливат, Л. и Бутин, Дж.: Поверхность Средиземного моря CO ₂ данные парциального давления и температуры, SEANOE [набор данных], https://doi.org/10.17882/56709, 2022. 

Мерливат, Л. и Браулт, П.: CARIOCA BUOY, Монитор углекислого газа, море Technol., 10, 23–30, 1995. 

Мерливат, Л., Бутин, Дж. и Антуан, Д.: Роли биологических и физические процессы в сезонном движении воздушно-морских потоков CO ₂ в Южном Океан: новые идеи от CARIOCA p CO ₂ , J. Mar. Syst., 147, 9–20, 2015. 

Мерливат, Л., Бутин, Дж., Антуан, Д., Бомонт, Л., Голбол, М., и Веллуччи, В.: Увеличение растворенного неорганического углерода и снижение рН в ближней -поверхностные воды Средиземного моря за последние два десятилетия, Biogeosciences, 15, 5653–5662, https://doi. org/10.5194/bg-15-5653-2018, 2018. 

Милло: Циркуляция в западной части Средиземного моря, J. Mar. систем, 20, 423–442, 1999. 

Морель, А. и Бертон, Дж. Ф.: Поверхностные пигменты, профили биомассы водорослей, и потенциальное производство эвфотического слоя: повторное исследование отношений в обзоре приложений дистанционного зондирования, Limnol. океаногр., 34, 1545–1562, 1989. 

Невядомска, К., Клаустр, Х., Приер, Л., и д’Ортенцио, F.: Субмезомасштабная физико-биогеохимическая взаимосвязь Лигурийское течение (северо-западное Средиземноморье) с использованием биооптического планера, Лимнол. океаногр., 53, 2210–2225, https://doi.org/10.4319/lo.2008.53.5_part_2.2210, 2008. 

Папайоанну, Г., Папаниколау, Н., и Реталис, Д.: Отношения фотосинтетически активное излучение и коротковолновое излучение // Теор. заявл. Climatol., 48, 23–27, 1993. 

Паскерон де Фоммерво, О., Мигон, К., Д’Ортенцио, Ф., Рибера д’Алькала, М., и Коппола, Л.: Временная изменчивость питательных веществ концентрации в северо-западной части Средиземного моря (временной ряд DYFAMED станция), Deep-Sea Res. Пт. I, 100, 1–12, 2015.

Пелликеро, В., Бутен, Дж., Клаустр, Х., Мерливат, Л., Салле, Ж.-Б., и Блейн, С.: Ослабление ветровой нагрузки приводит к резкому началу поглощение биологического углерода цветением Кергелена: мультисенсорный подход, Геофиз. Рез. Летт., 47, e2019GL085992, https://doi.org/10.1029/2019GL085992, 2020. 

Рёденбек, К., Килинг, Р. Ф., Баккер, Д. С. Э., Метцл, Н., Олсен, А., Сабин, К., и Хейманн, М.: Глобальная изменчивость потока поверхность-океан p CO ₂ и море-воздух CO ₂ по основанной на наблюдениях схеме смешанных слоев океана, Ocean Sci., 9, 193–216, https://doi.org/10.5194/os-9-193-2013, 2013. 

Румянцева А., Хенсон С., Мартин А., Томпсон А. Ф., Дамерелл Г. М., Кайзер, Дж., и Хейвуд, К.Дж.: Начало весеннего цветения фитопланктона: влияние атмосферное воздействие и свет в умеренном климате северной части Атлантического океана, прог. Океаногр., 178, 102202, г. https://doi.org/10.1016/j.pocean.2019.102202, 2019.  

Сигель, Д. А., Дони, С. К., и Йодер, Дж. А.: Северная Атлантика. весеннее цветение фитопланктона и гипотеза критической глубины Свердрупа, Науки, 296, 730–733, 2022. 

Свердруп, Х.У.: О весеннем цветении фитопланктона, Conseil Exp. Мер, 18 лет, 287–295, 1953. 

Такахаши, Т., Сазерленд, С. К., Ваннинхоф, Р., Суини, К., Фили, Р. А., Чипман, Д. В., Хейлз, Б., Фридерих, Г., Чавес, Ф., Сабина, К., Уотсон, A., Bakker, D.C.E., Schuster, U., Metzl, N., Yoshikawa-Inoue, H., Ishii, М., Мидорикава Т., Нодзири Ю., Корцингер А., Штайнхофф Т., Хоппема М., Олафссон Дж., Арнарсон Т.С., Тиллбрук Б., Йоханнессен Т., Олсен А., Беллерби Р., Вонг К. С., Делиль Б., Бейтс Н. Р. и де Баар Х. Дж. В.: Климатологические средние и десятилетние изменения в поверхностном океане p CO ₂ и чистый морской воздух CO ₂ поток над мировым океаном, Deep-Sea Res. Пт. II, 56, 554–577, 2009. 

Тейлор, Дж. Р. и Феррари, Р.: Прекращение турбулентной конвекции как новая критерий начала весеннего цветения фитопланктона, Limnol.